Thác nước mà thành phố được đặt tên theo đã được Joe Whitford (một người đánh bắt bằng bẫy Scotland) phát hiện vào năm 1856 và nhanh chóng được đặt tên để vinh danh ông chủ James Fergus. Không biết James Fergus đã từng đến thăm thành phố này hay chưa, nhưng Joe Whitford đã không sống để thấy thành phố phát triển, vì ông bị giết trong cuộc chiến Dakar năm 1862 ở miền tây Minnesota. Vào năm 1867, George B. Wright đến văn phòng tại St. Cloud và tìm thấy tuyên bố của Whitford, mua mảnh đất và xây dựng cái mà bây giờ là đập Trung tâm ở trung tâm thành phố Fergus Falls vào khoảng năm 1871. Sau khi Wright chết năm 1882, con trai của ông Vernon di chuyển từ Boston đến Minnesota và tiếp quản quyền lợi của cha mình trong thị trấn. Vern Wright cũng là một trong hai người thành lập Công ty Điện Otter Tail vào năm 1907. Thành phố được thành lập vào cuối những năm 1870 và nằm dọc theo đường phân chia giữa rừng rụng lá lâu năm của vùng Tây Bắc phía Đông, và Những đồng bằng tuyệt vời ở phương Tây, trong một khu vực những ngọn đồi dịu dàng, nơi mà lịch sử địa chất gần đây bị chi phối bởi sự suy thoái của các sông băng từ kỷ băng hà cuối cùng, với rất nhiều hồ và các con sông nhỏ.

Hai cơn lốc xoáy chính đổ vào Fergus Falls vào đầu thế kỷ 20, lần thứ hai, cơn lốc xoáy Fergus Falls năm 1919, lớn hơn. Toà nhà thờ duy nhất còn lại đứng sau cơn bão lớn là nhà thờ Báp tít màu đen chủ yếu.